После окончания войны был принят четвертый пятилетний план восстановления и развития народного хозяйства (1946-1950 гг.). Главной задачей коллектива института стало выполнение закона о пятилетнем плане. Но материальное положение оставалось очень тяжелым, на что особо обратил внимание председатель Всесоюзного комитета по делам высшей школы  С.В. Кафтанов на совещании руководителей вузов г. Казани. Он назвал институт «Жемчужиной высшего ветеринарного образования». Весной 1950 г. Совет Министров СССР принял решение о строительстве комплекса зданий для Казанского ветеринарного института. Строительство началось в 1953 г. и главный корпус был построен в 1961 г. В период восстановления народного хозяйства увеличился прием студентов с 125 до 200 человек. Число студентов увеличилось в два раза и 1950 г. составило 688 человек. Среди студентов много было участников Великой Отечественной войны. В 1950 г. вновь был открыт зоотехнических факультет, в 1959 г. – заочное отделение, в 1966 г. – факультет повышения квалификации ветеринарных врачей и ученых зоотехников, в 1967 г. – факультет повышения квалификации  преподавателей вузов и техникумов. Повышение квалификации ветеринарных врачей проводилось по различным профилям: клинико-эпизоотологическому, болезням молодняка, акушерству и борьбе с бесплодием, ветеринарному контролю за искусственным осеменением, вирусологии, ветеринарно-санитарной экспертизе и гражданской обороне. Преподаватели повышали квалификацию по хирургии, акушерству, физиологии, патофизиологии, анатомии и основам ветеринарии. Значительно изменился национальный состав студентов: в институте обучались представители 26 национальностей, увеличился удельный вес татар с 16,7% до 52,8-56,5%. В связи с увеличением числа студентов возросло количество преподавателей. В 1945/46 учебном году в институте работали 59 преподавателей (16 докторов, 25 кандидатов и 18 без ученой степени), 1959/60 учебном году – 98 (16 докторов, 49 кандидатов и 33 без степени), 1953/54 учебном году – 99 (17 докторов, зав. кафедрами, 10 доцентов, и.о. зав. кафедрами, 16 доцентов, 4 старших преподавателя и 52 ассистента-преподавателя). Группировка преподавателей по возрасту свидетельствует, что молодые преподаватели (до 35 лет) составляли 28,3 %, в возрасте 36-60 лет – 49,7 % и пенсионном возрасте 7 %, только профессору Боль К.Г. было 82 года. По стажу работы преподаватели распределились следующим образом: до 10 лет – 57,8 %, от 11 до 20 лет – 23,2, до 35 лет – 16, до 40 лет – 2 и 58 лет – 1 %; по национальности: русские – 68,8%, татары – 14,1 %, чуваши – 7 и другие национальности – 5 %.

В творческом освоении студентами изучаемых дисциплин важное значение имела самостоятельная научно-исследовательская деятельность и приобретение навыков анализа результатов научных исследований. Руководство студенческим научным обществом осуществлял профессор Н.А. Васнецов (1948-1959 гг.). Научные студенческие кружки существовали при многих кафедрах. Студенты выступали с научными докладами на заседаниях кружков, научных конференциях в институте, ветеринарных институтах Москвы, Ленинграда, Львова, Харькова, Кирова. Лучшие работы печатались в «Ученых записках». В послевоенные годы членами кружков были 168 студентов, они разработали 145 экспериментальных и 47 рефератных тем.

Большое внимание уделялось организации учебных и производственных практик, было организовано социалистическое соревнование на лучшую академическую группу.

Важной вехой в истории института является 1959 год: постановлением Советского правительства было решено преобразовать Казанский ветеринарный институт в крупный научно-исследовательский и учебный центр союзного значения. Ставилась задача интеграции высшего ветеринарного, зоотехнического образования и науки. Реализация этого решения продолжалась в течение второй половины двадцатого века.

На третьем этапе развития института (в годы ВОВ и послевоенного восстановления) директорами работали доцент Г.Н. Борисов (1939-1943 гг.), профессор В.Г. Мухин (1943-1945 гг.), доцент П.Т. Маширов (1945-1947 гг.), профессор Е.Н. Павловский (1947-1963 гг.). Послевоенный период характеризуется восстановлением народного хозяйства страны, в том числе строительством собственных зданий Казанского ветеринарного института. В этот период институт возглавлял дружный коллектив руководителей: ректор профессор Е.Н. Павловский (работал в институте 50 лет, в том числе 34 года заведующим кафедрой физиологии, 16 лет ректором, 4 года директором Казанского НИВИ), проректор по учебно-научной работе – профессор С.И. Афонский (1941-1948), профессор Н.В. Васнецов (1949-1954), доцент И.Ф. Таняшин (1954-1960), профессор Х.Г. Гизатуллин (1960-1963). На их долю выпала трудная задача по обеспечению выполнения сложных задач, поставленных перед коллективом института в суровые годы войны и трудные годы послевоенного восстановления народного хозяйства.

Сведения о выпуске ветеринарных врачей и зоотехников представлены в таблице

Выпуск ветеринарных врачей и зоотехников в период Великой Отечественной войны

и послевоенного восстановления народного хозяйства

За 20 лет выпущено 1609 ветеринарных врачей (по 80 человек в год) и 423 зоотехника (70 человек в год).

Доцент П.Г. Маширов — ректор института (1945-1947)

Профессор Е. Н. Павловский — ректор института (1947-1963)